Système d’exploitation Linux pour les Scientifiques (REAMOOC)

Système d’exploitation Linux pour les Scientifiques (REAMOOC)

Ce MOOC vise à former les apprenants à l’utilisation de Linux. A la fin de ce MOOC, les apprenants pourront effectuer les opérations de traitement de donner en ligne de commande (la manipulation des fichiers, l’écriture des programmes Shell, l’utilisation des outils de traitement de données).

Ce MOOC vise à former les apprenants à l’utilisation de Linux. A la fin de ce MOOC, les apprenants pourront effectuer les opérations de traitement de donner en ligne de commande ( La manipulation des fichiers, l’écriture des programmes Shell, l’utilisation des outils de traitement de données).

Plus precisement, ces opérations incluent ces opératons incluent :

  • La mise en œuvre des fonctionnalités courantes des utilisateurs
  • La manipulation des fichiers (création, suppression, Edition, listage, recherche) et de l'arborescence
  • L'utilisation des filtres pour le traitement des données
  • Utilisateur des éditeurs de texte (interactifs et en ligne)
  • L'utilisation des fonctions avancées des Shells
  • Utiliser les expressions régulières
  • L'utilisation de quelques outils avancés pour le traitement de données scientifiques sera présentée. Gnuplot, Panda, ...
  • Ecrire des programmes Shell

Description
Le système d’exploitation Linux est l'une des plateformes les plus importantes de l'écosystème de l'informatique moderne avec Microsoft Windows et Mac OS.
Ce système offre toutes les fonctionnalités et outils opensources nécessaires pour réaliser les tâches de base et avancées qui peuvent être réalisées sur un ordinateur, un smartphone, des systèmes embarqués, bref sur quasiment tous les systèmes électroniques grand public ou spécialisés (routeurs, TPE, plateforme SMS, ...). Quelques exemples d'utilisations :

  • Bureautique et Internet et Multimédia : C'est l'une des utilisations les plus répondue dans le grand public. Il existe une version Linux des navigateurs populaires (Chrome, Firefox, ...), des lecteurs audio vidéo tels (VLC, ...), ...
  • Programmation, traitement de données, automatisation et Cybersécurité : Linux est l’environnement préféré les développeurs et programmeurs ainsi que les spécialistes de cybersécurité. Il existe des distributions pour des tâches spécifiques comme Kali pour la cybersécurité, Linux Scientific,...
  • Serveurs de cloud et de calculs : Linux est un système incontournable pour le fonctionnement du cloud d'aujourd'hui (AWS d'Amazon, Azure de Microsoft et Google Cloud). C'est tellement important que Microsoft a crée sa distribution Linux en 2020 (CBL-Mariner) et permet de faire tourner de Linux sous Windows (Windows Subsystem pour Linux version 2 (WSL2))
  • Developpement Web et webscraping : Une bonne partie des serveurs Webs tournent sous Linux et Linux offre d'enormes possibilités de collecter des données dépuis des plateformes. Des entrepsies existent sur la base du WebScraping
  • Systèmes embarqués et Intelligence artificielle : Les plateformes embarqués les plus utilisées utilisent ou peuvent être programmés en utilisant Linux. Il y a Arduino, Raspberry, Jetson Nano, ... Le système de programmation avec de l'IA de Google qui est Google collab utilise des commandes compatibles Linux.

L’objectif de ce cours est de vous présenter les bases du système d'exploitation vous permettant de pouvoir en faire une utilisation suivant vos besoins. Il couvre tous les aspect à fondamentaux ainsi que quelques outils pour le traitement de données et la programmation Shell. Ce cours est accessible à tous ceux qui sont désireux d'en apprendre plus sur la ligne de commande Linux, la partie qui est spécifique aux scientifiques est liée à la programmation et le traitement de données. Toutefois il est bien possible qu’un non-scientifique puisse prendre en main ces outils.

Pre-requis
Aucun prerequis n'est necessaire pour saisir l'essentiel du cours mais une expérience antérieure avec les systèmes d'exploitation est un atout non négligeable. Toutefois, pour les outils de calcul scientifique, les connaissances mathématiques de base sont necessaires

Format du cours
Ce MOOC s’étend sur 9 semaines. Chaque semaine, vous accéderez à un module composé de différentes vidéos, exercices et activités à faire. Il y a deux types de vidéos : les vidéos théoriques qui explique les concepts, et des vidéos de démonstrations. Nous vous recommandons d’exécuter les commandes sur les vidéos de démonstrations. Si nécessaire vous pourrez chercher de la documentation complémentaire.
Les activités sont composées de Labs (des TP guidés pas à pas) et des QCM qui peuvent vous permettre de mieux comprendre et acquérir des compétences. C’est la partie qui vous permettra de vos connaissances théoriques apprises en regardant les vidéos. Il faut prévoir environ 3h00 à 4h00 par semaine dont en grande partie sur les Labs et les vidéos. En fonction de votre niveau cette durée peut varier à la hausse ou à la baisse.
Vous pouvez poster vos difficultés sur les différents forums du cours ainsi vous faire aider par l’équipe pédagogique ou les autres participants à la session. Enfin, vous aurez également accès à un forum encadré par une équipe pédagogique dynamique et motivée. Ce sera pour vous un lieu privilégié d’échanges avec une vaste communauté d’apprenants qui, tout comme vous, ont envie d’apprendre de nouvelles choses sur Linux.

Plan du cours

Module-0 : Présentation du MOOC

Module 1 : Généralités sur les systèmes UNIX/LINUX
Présentation du module
Section 1 : Structure d’un système informatique moderne et Systèmes d'exploitation
Section 2 : Systèmes UNIX, Linux, Projet GNU
Section 3 : Distributions Linux et Usages de Linux

Module 2 : Shell, Commandes et aide en ligne
Présentation du module
Section 1 : Le Shell
Section 2 Commandes Unix
Section 3 : Documentation en ligne des commandes

Module 3 : Manipulation du système de fichier
Présentation du module
Section 1 : Fichier, arborescence et chemin
Section 2: Navigation dans le système de fichier
Section 3 : Gestion des fichiers et repertoires
Section 4 : Recherche de fichiers
Section 5 : Liens : symboliques et physiques
Section 6 : Gestion des droits sur les fichiers

Module 4 : Edition et traitement de données textuelles
Présentation du module
Section 1: Caractères spéciaux de Bash et WildCards
Section 2: Affichage en ligne
Section 3: Filtres : Tri, sélection, remplacement
Section 4: Filtres : Recherche, comptage et formattage
Section 5: Archivage et compression de données

Module 5: Utilisation de quelques outils de traitement de données
Présentation du module
Section 1: Catégories d'outils de traitement de données sous Linux
Section 2: Editeur de stream : sed
Section 3: Editeur de stream : awk
Section 4: Introduction à gnuplot
Section 5: Introduction à l'utilisation de pandas

Module 6: Initiation à la Programmation SHELL BASH
Présentation du module
Section 1: Création et execution d'un script SHELL
Section 2: Variables, entrées/sorties et expressions
Section 3: Chaines de caractères et listes
Section 4: Instructions if et les opérateurs de test
Section 5 : Boucles : for, while, until, select
Section 6: Fonctions
Conclusion et Evaluation finale

Go to Class
MOOC List is learner-supported. When you buy through links on our site, we may earn an affiliate commission.

Related Courses

Interagir com sistemas operativos (Coursera) Coursera
Google

Interagir com sistemas operativos (Coursera)

Neste curso, através de uma combinação de palestras em vídeo, demonstrações e experiências práticas, vai adquirir conhecimentos acerca dos componentes principais de um sistema operativo e como realizar tarefas críticas, como gerir software e utilizadores e configurar hardware. Vamos terminar com um exemplo de como este conteúdo pode surgir no contexto de uma entrevista.

Jun 8th 2026
5-12 Weeks
Using Python to Interact with the Operating System (Coursera) Coursera
Google

Using Python to Interact with the Operating System (Coursera)

By the end of this course, you’ll be able to manipulate files and processes on your computer’s operating system. You’ll also have learned about regular expressions -- a very powerful tool for processing text files -- and you’ll get practice using the Linux command line on a virtual machine. And, this might feel like a stretch right now, but you’ll also write a program that processes a bunch of errors in an actual log file and then generates a summary file. That’s a super useful skill for IT Specialists to know.

Jun 9th 2026
5-12 Weeks
C Programming: Using Linux Tools and Libraries - 7 (Coursera) Coursera
Institut Mines-Telecom,Dartmouth College

C Programming: Using Linux Tools and Libraries - 7 (Coursera)

Learn how to use professional tools and libraries to write and build C programs within the Linux operating system. This seventh and final course in the C Programming with Linux Specialization will allow you to develop and use your C code within the Linux operating system. Using libraries in C is a fundamental concept when it comes to sharing code with others. In addition to compiling and linking, you will also learn how to pass arguments to an executable program.

Jun 8th 2026
3 Weeks
Sistemas Operacionais e Você: Tornando-se um Usuário Avançado (Coursera) Coursera
Google

Sistemas Operacionais e Você: Tornando-se um Usuário Avançado (Coursera)

Neste curso – com uma combinação de palestras em vídeo, demonstrações e atividades práticas – você conhecerá os principais componentes de um sistema operacional e verá como executar tarefas críticas, como gerenciamento de software e usuários, e configuração de hardware. Vamos terminar com um exemplo de como esse conteúdo pode acabar surgindo em uma entrevista.

Jun 8th 2026
5-12 Weeks
Intro to Operating Systems 3: Concurrency (Coursera) Coursera
Codio

Intro to Operating Systems 3: Concurrency (Coursera)

Learn the inner workings of operating systems without installing anything! This course is designed for learners who are looking to maximize performance by understanding how operating systems work at a fundamental level. The modules in this course cover concurrency, threads, locks, locking data structures and multi-CPU scheduling.

Jun 8th 2026
4 Weeks
Basic Data Processing and Visualization (Coursera) Coursera
University of California, San Diego

Basic Data Processing and Visualization (Coursera)

This is the first course in the four-course specialization Python Data Products for Predictive Analytics, introducing the basics of reading and manipulating datasets in Python. In this course, you will learn what a data product is and go through several Python libraries to perform data retrieval, processing, and visualization.

Jun 8th 2026
5-12 Weeks
Network Analysis in Systems Biology (Coursera) Coursera
Icahn School of Medicine at Mount Sinai

Network Analysis in Systems Biology (Coursera)

An introduction to data integration and statistical methods used in contemporary Systems Biology, Bioinformatics and Systems Pharmacology research. The course covers methods to process raw data from genome-wide mRNA expression studies (microarrays and RNA-seq) including data normalization, differential expression, clustering, enrichment analysis and network construction. The course contains practical tutorials for using tools and setting up pipelines, but it also covers the mathematics behind the methods applied within the tools.

Jun 8th 2026
5-12 Weeks
Predictive Modeling and Machine Learning with MATLAB (Coursera) Coursera
MathWorks

Predictive Modeling and Machine Learning with MATLAB (Coursera)

In this course, you will build on the skills learned in Exploratory Data Analysis with MATLAB and Data Processing and Feature Engineering with MATLAB to increase your ability to harness the power of MATLAB to analyze data relevant to the work you do. These skills are valuable for those who have domain knowledge and some exposure to computational tools, but no programming background.

Jun 8th 2026
4 Weeks
Real-Time Embedded Systems Concepts and Practices (Coursera) Coursera
University of Colorado Boulder

Real-Time Embedded Systems Concepts and Practices (Coursera)

This course can also be taken for academic credit as ECEA 5315, part of CU Boulder’s Master of Science in Electrical Engineering degree. Course Description: In this course, students will design and build a microprocessor-based embedded system application using a real-time operating system or RT POSIX extensions with Embedded Linux. The course focus is on the process as well as fundamentals of integrating microprocessor-based embedded system elements for digital command and control of typical embedded hardware systems.

Jun 8th 2026
4 Weeks
Princípios básicos de apoio técnico (Coursera) Coursera
Google

Princípios básicos de apoio técnico (Coursera)

Este curso é o primeiro de uma série que visa a sua preparação para uma função de especialista de apoio técnico de TI de nível básico. Neste curso, ser-lhe-á apresentado o mundo das TI (Tecnologias de Informação). Vai descobrir as diferentes facetas das Tecnologias de Informação, como o hardware informático, a Internet, o software informático, a resolução de problemas e o serviço de apoio ao cliente. Vamos analisar como é que pode ser realizada uma entrevista técnica e fornecer sugestões sobre a melhor forma de se preparar para uma.

Jun 8th 2026
5-12 Weeks